Hoe de LPS-synthese van GNB kan worden beïnvloed, zodat LPS en GNB gemakkelijk door de gastheer kunnen worden herkend en gewist, is ook een maatregel om endotoxemie te behandelen. Bij entheogene endotoxemie heeft Escherichia coli (E.coli) een typische LPS-structuur, die gemakkelijk kan ontsnappen aan de fagocytose-klaringsreactie van de gastheer, de sterke biologische activiteit van endotoxine vertoont en verschillende toxische effecten veroorzaakt. Daarom wordt bij de studie van endotoxinen de LPS van E. coli vaak gebruikt om de biologische effecten van endotoxine te evalueren en verschillende interventiemaatregelen te evalueren; Wanneer exogene GNB is geïnfecteerd, mist de LPS-structuur de typische LPS-structuur en is de toxiciteit relatief laag, wat gemakkelijk door de gastheer kan worden gewist.

Duitse geleerde Seydel et al. plaatste LPS-aggregaatmacromoleculen in fysiologische zoutoplossing, gebruikte IL-6 uitgescheiden door macrofagen als indicator en gebruikte synchrotronstraling röntgendiffractietechnologie om de driedimensionale structuur van verschillende LPS te analyseren. Het bleek dat LPS met een kegelstructuur een sterke biologische toxiciteit heeft, terwijl de kubische chemische structuur van een cilinderstructuur geen of een lage toxiciteit heeft. Hexaacyllipide A van E.coli is een omgekeerde kubusstructuur, terwijl pentadactyllipide A en tetradecyllipide A van E.coli een multilaminaire structuur vormen en de neiging hebben een lichte micellaire structuur te hebben; Echter, c.jejuni lipide A is een unilamellaire structuur met een lichte neiging om zich te ontwikkelen tot een omgekeerde kubusstructuur. Alle andere lipide A vormt zonder uitzondering meerlaagse structuren. Elke lipide A van darmbacteriën hexadecyl is conisch of concaaf, het pentadactyllipide is voornamelijk cilindrisch en tetradecyllipide A is cilindrisch en heeft de neiging om conisch of convex te worden (de dwarsdoorsnede van de hydrofobe zone is iets kleiner dan dat van de hydrofiele zone).

De huidige gegevens laten zien dat er een gemeenschappelijk principe is voor LPS in endotoxine. Alleen de conische of concave fysieke vorm van lipide A heeft een hoge biologische activiteit, zoals E. coli in de darm. LPS mist agonistische activiteit en is gerelateerd aan de cilindrische vorm van lipide A. LPS zonder acylgroep betekent niet dat het als een antagonist kan worden gebruikt. Het kan zijn dat wanneer endotoxine wordt geïnternaliseerd in monocyten, macrofagen, neutrofielen en dendritische cellen, het enzymatisch wordt gehydrolyseerd door acylcarboxylhydrolase (AOAH) om deacyllipide A te produceren, en tegelijkertijd verandert het zijn driedimensionale morfologie. Op dit moment heeft het geen toxisch effect. Het is duidelijk dat de aan- of afwezigheid van acylgroepen in LPS niet betekent dat het niet-toxisch is. Het is noodzakelijk om de driedimensionale structuur ervan te begrijpen.

Het biologische effect van endotoxine en de hoeveelheid negatieve lading van LPS, het aantal acylketens, de verdeling van de acylgroep, de mate van vetzuurverzadiging van de acylketen en de verandering van stereoconformatie hebben allemaal invloed op de activiteit van endotoxine. Deze conclusie kan een theoretische basis vormen voor het ontwerp van LPS-analogen en ervoor zorgen dat ze het effect van toxische LPS tegenwerken.